Fakulta managementu a ekonomiky participovala od svého vzniku na zajištění společného doktorského studijního programu 6208 Ekonomika a management ve studijním oboru 62-32-9 Řízení a ekonomika podniku, jehož garantem je Fakulta podnikatelská Vysokého učení technického v Brně. Od roku 2001 byl na FaME akreditován vlastní doktorský studijní program Ekonomika a management, obor Management a ekonomika. V roce 2001 byli přijatí uchazeči po dohodě s FP VUT v Brně převedeni do DSP akreditavaneho na FaME. V roce 2006 byl akreditován doktorský studijní program Economics and Management, obor Management and Economics. Přehled o počtu přijímaných studentů a absolventech tohoto programu je uveden v následující tabulce.

DSP Ekonomika a management, obor Management a ekonomika

 přihlášení uchazeči přijatí uchazeči
rokinterníexternícelkeminterníexternícelkemabsolventi
20011519340
200211182957120
200320113197161
2004181634717148
200518335111142510
20061329422218409
20072344672114354
200823315417284520
200913274026255119
201020274718183617
201135336824194213
2012218291341719
2013251237 1372013
20143714512283015
20155316691251713
20164619651511265
201740165616132910
20183616521615318
Od roku 2007 je na FaME akreditován doktorský studijní program Hospodářská politika a správa, obor Finance a Economic Policy and Administration, obor Finance.
Od roku 2011 je doktorský studijní program Hospodářská politika a správa, obor Finance a Economic Policy and Administrationn, obor Finance akreditován se standardní dobou studia 4 roky, s dobou platnosti do 31. května 2019. 
DSP  Hospodářská politika a správa, obor Finance.
 přihlášení uchazeči přijatí uchazeči
rokinterníexternícelkeminterníexternícelkemabsolventi
20072352350
20084121649130
2009210122791
20102462351
201164103258
201267134593
201358132571
20141552082103
201536145067131
2016193225163
2017112133251
201874114376